Fatima AlZahra'a Alatraktchi
Afkodning af bakteriel virulens: Diagnostik og prognose af infektionsforløb (DECODE)
Lektor Fatima AlZahra'a Alatraktchi vil udvikle et værktøj til diagnostik og prognose målrettet tre af de bakterier, som WHO har på listen over de farligste. Lykkes det, kan hun vende op og ned på lægers håndtering af infektioner.
Fatima vil udvikle et værktøj til at afsløre farlige bakterier
Et lille håndholdt apparat og en analyseplatform kan i kombination blive et værktøj, som kan redde liv på sygehusene i fremtiden.
Med apparatet i hånden kan lægen teste en enkelt dråbe blod, spyt eller urin fra patienten for bakterier. Nanosensorer i apparatet registrerer stoffer, som bakterierne udskiller, og resultaterne overføres automatisk til analyseplatformen. Umiddelbart derefter får lægen ikke alene navnet på bakterierne, men også en prognose på, hvor fremskreden infektionen er, om den er på fremmarch eller retræte, hvorvidt bakterierne er antibiotika-resistente, og hvilke midler, de kan bekæmpes med.
Sådan nogenlunde forestiller lektor Fatima AlZahra'a Alatraktchi sig fremtiden med det værktøj, hun nu med sit LF Fellowship kan gå i gang med at udvikle i projektet DECODE på Institut for Naturvidenskab og Miljø på Roskilde Universitet (RUC).
Fatima AlZahra'a Alatraktchi er både nanofysiker og mikrobiolog og arbejder i krydsfeltet mellem de to discipliner. Hun er også forfatter og har netop udgivet en bog med titlen: ”Besat af bakterier”. Og det er hun.
”Jeg har været optaget af bakteriernes ’sprog’, siden jeg under min bachelor blev klar over, at bakterier kommunikerer. Så det her er et drømmeprojekt for mig,” siger hun.
”Bakterier taler sammen ved at udskille molekyler, mens de inficerer os. Kan vi ’oversætte’, hvad de siger, kan vi måske finde ud af, hvor farlige de egentlig er.”&Բ;
I projektet skal forskerne arbejde med molekyler, som er biomarkører for tre bakterier fra WHO’s liste over høj-risiko-bakterier. Bakterierne er velkendte på sygehusene hos patienter med henholdsvis blodforgiftning, alvorlige urinvejsinfektioner og hos patienter i respirator.
For hver af bakterierne skal sensorer reagere på såkaldte virulensfaktorer (VRs). Det er molekyler, bakterierne udskiller tidligt i infektionen, og som gør dem farlige. VRs kan for eksempel få bakterierne til at skade vævet eller undvige immunforsvaret.
Fatima AlZahra'a Alatraktchi har tidligere udviklet nanosensorer. I projektet skal hendes forskergruppe udvikle og optimere sensorteknologier specifikt til de tre bakterier. Og de skal karakterisere bakterierne og deres VRs under forskellige forhold, og udsætte dem for antibiotika og for immunforsvarets molekyler.
”Det centrale er at opnå en dyb forståelse af biomarkørernes betydning i relation til sygdomstilstande, forløbet af en infektion og udvikling af resistens. Og selvfølgelig at teste det hele i klinisk sammenhæng,” siger Fatima AlZahra'a Alatraktchi.
Målet er at give lægerne et værktøj til hurtig, præcis og individualiseret behandling af patienter med infektioner.
”I dag kan det tage dage at få prøvesvar fra laboratoriet, og lægen forsøger sig måske i mellemtiden med et middel, der ikke virker,” forklarer Fatima AlZahra'a Alatraktchi. Det vil hun ændre med DECODE. Og projektet har vide perspektiver.
”Hvis vi lykkes med et værktøj til de her tre bakterier, kan vi skalere til andre sygdomsfremkaldende bakterier og udvide patientgruppen. Så har vi en regulær omvæltning af, hvordan vi diagnosticerer. Det kan potentielt både begrænse forbruget af antibiotika og redde liv,” slutter hun.
Alder: 37
Uddannelse: Cand.polyt.-uddannelse i nanofysik, DTU, Ph.d. i nanoteknologi og molekylær biologi, DTU
æڳپ: lektor ved Institut for Naturvidenskab og Miljø på Roskilde Universitet (RUC).
Fokus: Kortlægning af bakteriernes ’sprog’ og ’værktøjer’ til at registrere og afkode bakteriernes signaler med henblik på forbedring af diagnostik og prognose af infektionsforløb.
Foto: Stine Heilmann